正常磁控管损坏的原因有：
1、散热不好。工作时出现电压相对很高，电流很大，温度高的情况，如果冷却系统出故障，管子很容易损坏；其次磁控管产生的高频能量向外传输时，因输出端用玻璃密封，会使它产生介质损耗而发热，使温度过高。如果散热不好，导致玻璃熔化而使磁控管损坏。
2、使用不当。一是灯丝预热不足或灯丝电流不稳，出现过大、过小的情况均会引起磁控管损坏
3、负载严重不匹配。例如：磁控管输出耦合与波导之间装置不良；波导内有水汽或其它杂物；波导未加负载。
4、铁质物质的影响。将铁质物质靠近管子磁铁，会损坏磁道，减弱磁场。磁控管工作中将引起大量高速电子直接撞击阳极，使磁控管过热而损坏。
5、磁控管灯丝被振断。
防止磁控管损坏的措施及改进方法有：
1、确保冷却系统正常工作。
2、提高技术水平，正确使用磁控管。
3、尽可能使之匹配。
改进磁控管灯丝被振断的措施是：①减振，如在灯丝变压器次级增加一个整流滤波装置，把交流变直流。②降低起始大电流，如在灯丝变压器初级串联一只限流电感，可以有效地限制灯丝电流的最大值，防止灯丝初始电流过大。另外，还可以采用分段加灯丝电压的方法，把灯丝电流控制在规定的范围内。
