我国的食品添加剂近几年在生产应用技术水平、产品质量、成本、品种等方面取得了巨大的进步，但和国外发达国家相比，仍存在较大差距，主要表现在以下几个方面：
行业大而不强，尽管我国食品添加剂行业产能增长迅速，产能居于世界前列，但是整体行业呈现大而不强态势，主要体现在：企业规模普遍较小，布点分散，仅有少数龙头企业，产品档次低，研发能力低下，如柠檬酸国内有近百家企业，每年产能超过万吨级的仅不到20家，企业抗风险能力不强;国内香料、香精生茶企业近700家，销售收入超亿元的仅有二十余家。
生产技术落后，尤其是环保压力较大，可持续发展能力薄弱，目前国内味精、柠檬酸、苯甲酸钠等许多产品生产过程中产生大量废液难以治理，环境污染严重。
部分产品产能严重过剩，如国内柠檬酸、维生素C、山梨醇等产品销售主要依赖国际市场，由于产能过剩导致恶性竞争，价格持续走低，生产装置经济效益差，另外许多新开发小品种也逐步呈现盲目建设，产能扩增过快的现象。
品种少、产品结构不合理，目前国内现有添加剂约1600种，与全球市场上4000多种相比不到一半，许多种类产品结构不合理，国外蛋白酶品种占总量的近40%，而我国仅为12%左右，国内落后的面临淘汰的食品添加剂仍大量生产，如苯甲酸钠、糖精等品种。
安全隐患大，容易被国外市场采取安全等非关税贸易壁垒拒之门外，如西欧一些国家曾经提出甜菊糖有毒，目前美日及部分东南亚国家禁止食品中使用甜蜜素，即使是一些天然提取的色素，香精也有部分被国外不同国家和地方禁用，国内对此重视不够;另外我国新品开发能力薄弱，企业管理不到位导致产品质量低下或者不稳定，服务意识淡薄，天然提取高新技术和生物化工技术在食品添加剂行业较少，国外主要食品添加剂生产企业加快在国内合作合资步伐等诸多因素都影响了我国食品添加剂工业的未来发展。
